产品介绍:
KAPA hgDNA定量&QC试剂盒,包含人类基因组DNA样品NGS文库构建前,所有基于qPCR定量及质量评估的试剂。
KAPA hgDNA定量&QC试剂盒,是基于SYBR Green I染料法优化的高质量qPCR检测试剂盒,包含KAPA SYBR® FAST qPCR Master Mix预先稀释的一系列DNA标准品,以及针对于人类基因组单拷贝的高度保守区域的不同位点所设计的引物预混液。最小片段所对应的引物,用于获得绝对定量的结果,而额外的引物,用于获得在DNA样本中可扩增模板量(质量高的核酸片段)的信息。这个试剂盒由此所产生的质量分数(即Q-ratios),可以用于预测文库的产量,或者对于如FFPE DNA这类样本质量变化很大的样本的工作流程进行调整。
产品名称:KAPA hgDNA定量及QC试剂盒
产品货号:KK4960
产品特点:
在单次检测中,同时评估样本量以及样本质量
可以将质量分数(Q-ratios)与测序相关指标相关联
高性能的KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix
预先稀释好的DNA标准品以及可以直接使用的引物
多功能、易于自动化的工作流程
产品原理:
一组DNA标准品,使用三对不同引物,用于产生(最多)三组标准曲线。这三对引物的扩增目标,位于某高度保守、单拷贝的人类基因组位点,其大小分别为41 bp, 129 bp以及305 bp。41 bp检测用于DNA样品的绝对定量。对于评估DNA质量,使用129 bp和/或305 bp引物预混液生成标准曲线并且检测样本。由于低质量的DNA样本的长片段扩增效率会大幅度降低,相对的DNA质量可以通过41 bp检测的浓度,对于129 bp或者305 bp检测的浓度进行均一化,或者在此DNA样本中可被扩增的物质的量来进行推测。这种通过标准化产生的质量分数(值介于0和1之间),可以用于指示DNA的质量,或者在此DNA样本中可被扩增的物质的量。
产品优势:
指示样品是否有足够的量以及质量来成功构建文库
未通过质控的样本,不再进行后续文库构建以及测序步骤,从而节约时间和精力
使用预期:
Q129/41 比值和测序中的关键指标(如重复率)具有相关性
从250 ng Covaris打断的FFPE DNA样本(n=14)和对照组DNA(分别从培养细胞、新鲜冰冻样本和血液中提取,n=6),进行手动文库构建。样本按照Q129/41-比例升序在x轴上从左至右排列(FFPE样本用黄色表示,对照组DNA用橙色表示)。文库构建采用的是NEBNext® 试剂(New England Biolabs),其中靶标捕获前和靶标捕获后的扩增环节(10个循环)采取KAPA HiFi 试剂盒。靶标捕获使用的是定制的SeqCap EZ panel (300 genes,0.9 MB)。 在Illumina HiSeq平台上进行了测序(2 x 100 bp)。FFPE样本的平均靶标覆盖率(蓝色点)是对照组的四倍(1,247X, vs. 301X),平均重复率(红色点)是对照组的两倍(75% vs. 38%)。Q129/41 比值 > 0.4 的FFPE样本所产出的文库能够达到测序质量要求。
产品订购信息
产品名称:KAPA hgDNA定量及QC试剂盒
产品货号:KK4960
关于公司:
Kapa Biosystems位于美国马萨诸塞州威尔明顿,是一家蛋白质工程专家及基因组学工具供应商,致力于研发、生产下一代测序(NGS)所需的生物酶及相关试剂,该公司基于直接分子进化平台开发的产品已被广泛用于DNA扩增、测序、基因组学研究、分子诊断等领域。
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