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illumina NextSeq 500/550 v2测序试剂盒

  • 型   号:FC-404-2003
  • 价   格:

产品:illumina NextSeq 500/550 v2测序试剂盒(300 cycles)
在 NextSeq 500/550上执行测序运行需要使用一次性 NextSeq 500/550试剂盒。每个试剂盒包含一个流动槽和一次测序运行所需的试剂。流动槽、试剂夹盒和缓冲液夹盒均使用射频识别(radio-frequency identification,简称RFID)进行精确的耗材跟踪并确保兼容性。

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产品名称:NextSeq 500/550 Mid Output v2 kit (300 cycles)

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产品货号:FC-404-2003

适用系统:illumina NextSeq 500, NextSeq 550测序仪

产品介绍:

在 NextSeq 500/550上执行测序运行需要使用一次性 NextSeq 500/550试剂盒。每个试剂盒包含一个流动槽和一次测序运行所需的试剂。流动槽、试剂夹盒和缓冲液夹盒均使用射频识别(radio-frequency identification,简称RFID)进行精确的耗材跟踪并确保兼容性。 

NextSeq 500/550 v2测序试剂盒将高通量测序系统的功能整合到台式计算机中,不仅改善了数据质量,而且使无错误片段产率达到zui高水平。此试剂盒具有下列优点:出色的碱基检出,提升的信噪比

提供多种测序输出和片段长度选择方案

试剂夹盒配置简化,工作流程和夹盒上样改善

提供直观标记和RFID编码试剂

采用的边合成边测序(SBS)和桥式扩增簇生成技术,优化化学过程

此试剂盒不仅提供强大的测序化学过程,而且将手动操作时间压缩至短短10分钟。直观标记和RFID编码试剂确保与用户自定义的运行配置兼容。

 

NextSeq 500/550 v2套件已于2018年12月31日停产; 出货量持续到2019年2月28日.TG版本不受影响。NextSeq 500/550 v2.5套件是替代产品,与v2套件相比,具有更高的稳定性和坚固性。)

 

产品名称:illumina NextSeq 500/550 v2测序试剂盒(300 cycles)        产品货号:FC-404-2003

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产品名称:NextSeq 500/550 Mid Output v2 kit (300 cycles)

产品货号:FC-404-2003

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Illumina二代测序技术,边合成边测序(SBS),是广泛采用的新一代测序(NGS)技术,负责产生世界上90%以上的测序数据。

Illumina的二代测序技术称为边合成边测序(Sequencing-by-Synthesis,简称SBS)。SBS主要包括碱基延伸、荧光激发及信号收集、剪切等3个步骤。这3个步骤可以重复,循环进行。每循环一次测定一个碱基。想测定多少个碱基(即读长),就循环多少次。测序循环次数可以在软件里设定。到底测序多长合适,要根据项目性质和需求来决定。大多数情况下,SR实验(单端测序)测定1x50个碱基,PE实验(双端测序)测定2x150个碱基。

1 碱基延伸

Illumina测序试剂里所使用的dNTP特色,它们同时具有两个修饰基团:一个荧光基团,一个可逆终止基团。A、G、C、T 4种碱基分别标记4种不同的荧光基团,它们在不同波长的激光激发下,能够发射不同波长(即颜色)的荧光。荧光颜色与碱基种类一一对应,因此根据激发光的波长可以识别碱基。4种碱基的终止基团是一样的。由于终止基团的存在,所有dNTP每次都只能延伸1个碱基,无论给予多长的反应时间。又由于该终止基团是可逆的,在荧光信号收集完毕之后,可以用剪切剂切除该终止基团,使碱基恢复自然的可延伸状态,这时即可继续进行下一轮循环,再测定一个碱基。

可逆终止基团技术是Illumina二代测序的一大特色。它与桥式PCR技术一起,构成了Illumina二代测序的两大支柱,为稳定获得高质量的测序数据打下了坚实的基础。

2 信号采集

HiSeq系列测序仪具有红绿两根激光管,两个滤色片。它们两两组合,可以形成4种不同的激发波长,正好分别用于激发A、G、C、T 4种碱基。

Cluster上所标记的荧光基团在激光激发下产生的信号,可以用相机拍摄或者扫描的方式收集信号。扫描技术速度比较快,被X10系列采用。由于FC面积比较大,而且上表面和下表面要分别拍照,所以拍照过程相当耗时。对于经典的HiSeq 2000来说,一次测序循环所产生的荧光信号,需要大约40分钟的时间才能拍照收集完毕,时间比测序反应本身还要长。

3 剪切

荧光信号收集完毕后,关闭激光,用剪切剂去除测序引物的延伸产物上的碱基所标记的荧光基团和终止基团。两个修饰基团均被切除,一方面消去干扰荧光,一方面使链末端的碱基回复到自然的可延伸状态,为下一轮测序做好准备。

再重复合成、激发、收集等步骤,即可进行第二个碱基的测序。

测序循环可以重复多次。理论上可以一直重复,直到信噪比降低得无法有效识别碱基信号为止。由于荧光基团的发光效率持续不断在衰减,Taq酶的活性也在持续不断地衰减,所以实际上测序循环次数是有限的,大重复次数与sbs试剂的配方有关。测序的循环次数可以在软件设置过程中人为,这个重复次数就是每个测序片段的读长。目前,Illumina平台的读长有2x100 bp,2x125 bp,2x150 bp,2x300 bp等多种,其中2x150 bp用得较广泛。

 

单端测序:单端测序(Single-read)首先将DNA样本进行片段化处理形成200-500bp的片段,引物序列连接到DNA片段的一端,然后末端加上接头,将片段固定在flow cell上生成DNA簇,上机测序单端读取序列。

双端测序:双端测序(Paired-end)方法是指在构建待测DNA文库时在两端的接头上都加上测序引物结合位点,在*轮测序完成后,去除*轮测序的模板链,用对读测序模块(Paired-End Module)引导互补链在原位置再生和扩增,以达到第二轮测序所用的模板量,进行第二轮互补链的合成测序。

 

cDNA文库:以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。cDNA文库特异地反映某种组织或细胞中,在特定发育阶段表达的蛋白质的编码基因,因此cDNA文库具有组织或细胞特异性。

cDNA文库是以特定的组织或细胞mRNA为模板,逆转录形成的互补DNA(cDNA)与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌形成重组DNA克隆群,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织或细胞的cDNA文库。cDNA文库特异地反映某种组织或细胞中,在特定发育阶段表达的蛋白质的编码基因,因此cDNA文库具有组织或细胞特异性

cDNA文库显然比基因组DNA文库小得多,能够比较容易从中筛选克隆得到细胞特异表达的基因。但对真核细胞来说,从基因组DNA文库获得的基因与从cDNA文库获得的不同,基因组DNA文库所含的是带有内含子和外显子的基因组基因,而从cDNA文库中获得的是已经过剪接、去除了内含子的cDNA。

真核生物基因组DNA十分庞大,其复杂程度是蛋白质和mRNA的100倍左右,而且含有大量的重复序列. 采用电泳分离和杂交的方法,都难以直接分离到目的基因.这是从染色体DNA为出发材料直接克隆目的基因的一个主要困难。

高等生物一般具有10^5种左右不同的基因,但在一定时间阶段的单个细胞或个体中,都仅有15%左右的基因得以表达,产生约15000种不同的mRNA分子.可见,由mRNA出发的cDNA克隆,其复杂程度要比直接从基因组克隆简单得多。

cDNA文库在研究具体某类特定细胞中基因组的表达状态及表达基因的功能鉴定方便具有特殊的优势,从而使它在个体发育、细胞分化、细胞周期调控、细胞衰老和死亡调控等生命现象的研究中具有更为广泛的应用价值,是研究工作中较常使用到的基因文库。

 

产品名称:NextSeq 500/550 Mid Output v2 kit (300 cycles)

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