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illumina Nextera DNA文库制备试剂盒
illumina Nextera DNA文库制备试剂盒 (24 samples) 货号:FC-121-1030较快较简单的文库制备流程。制备全基因组测序文库不到90分钟,而手工操作不到15分钟。借助Nextera技术,在一个步骤中利用转座酶将DNA同时片段化并加上测序接头进行标记。此操作流程适用于数量有限的珍贵样本,只需要50 ng的起始DNA。
产品名称:Nextera DNA Library Prep Kit (24 samples)
(附推广:Service(服务类)相关产品,如有需求,请在推文中查询;更多产品,欢迎咨询)
产品货号:FC-121-1030
(对于全基因组测序,Nextera DNA Flex文库制备试剂盒是Nextera DNA文库制备试剂盒的推荐替代品,该试剂盒已停产。如果您使用的是用于ATAC-Seq或其他定制应用的Nextera DNA文库制备试剂盒,欢迎你的咨询)
产品卖点:
较快较简单的文库制备流程。制备全基因组测序文库不到90分钟,而手工操作不到15分钟。
借助Nextera技术,在一个步骤中利用转座酶将DNA同时片段化并加上测序接头进行标记。此操作流程适用于数量有限的珍贵样本,只需要50 ng的起始DNA。
这款试剂盒提供较快较简单的操作流程,90分钟就可以构建好上及测序的文库,手动操作的时间少于15分钟。一步即可完成片段打碎和连接接头的步骤,不需要特殊设备,实验室的常规设备即可完成整个文库构建。并且建好的文库可以适用于illumina的任何测序平台。
采用Nextera技术,一步即可完成片段打碎和连接接头的步骤,不需要特殊设备,实验室的常规设备即可完成整个文库构建。较适合样本量极其稀少的珍贵样本进行建库,这种建库方法只需要50ng的建库起始量。并且可以在任何illumina测序设备上进行测序。
Nextera建库试剂盒还需要配合使用TruSeq Dual Index Sequencing Primer Box(FC-121-1003单端/PE-121-1003双端),不论是单端测序还是双端测序,不论是否有index,还是单端或双端index,这个试剂盒都是必须的。
另外 Nextera Index kit (FC-121-1011 or FC-121-1012)对于Nextera文库构建也是必需的。不论是混合多少样本在一个pooling中。
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红荣微再(上海)生物工程技术有限公司
产品名称:illumina Nextera DNA文库制备试剂盒 (24 samples) 产品货号:FC-121-1030
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DNA文库制备试剂盒类:
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Illumina二代测序技术,边合成边测序(SBS),是广泛采用的新一代测序(NGS)技术,负责产生世界上90%以上的测序数据。
Illumina的二代测序技术称为边合成边测序(Sequencing-by-Synthesis,简称SBS)。SBS主要包括碱基延伸、荧光激发及信号收集、剪切等3个步骤。这3个步骤可以重复,循环进行。每循环一次测定一个碱基。想测定多少个碱基(即读长),就循环多少次。测序循环次数可以在软件里设定。到底测序多长合适,要根据项目性质和需求来决定。大多数情况下,SR实验(单端测序)测定1x50个碱基,PE实验(双端测序)测定2x150个碱基。
1 碱基延伸
Illumina测序试剂里所使用的dNTP特色,它们同时具有两个修饰基团:一个荧光基团,一个可逆终止基团。A、G、C、T 4种碱基分别标记4种不同的荧光基团,它们在不同波长的激光激发下,能够发射不同波长(即颜色)的荧光。荧光颜色与碱基种类一一对应,因此根据激发光的波长可以识别碱基。4种碱基的终止基团是一样的。由于终止基团的存在,所有dNTP每次都只能延伸1个碱基,无论给予多长的反应时间。又由于该终止基团是可逆的,在荧光信号收集完毕之后,可以用剪切剂切除该终止基团,使碱基恢复自然的可延伸状态,这时即可继续进行下一轮循环,再测定一个碱基。
可逆终止基团技术是Illumina二代测序的一大特色。它与桥式PCR技术一起,构成了Illumina二代测序的两大支柱,为稳定获得高质量的测序数据打下了坚实的基础。
2 信号采集
HiSeq系列测序仪具有红绿两根激光管,两个滤色片。它们两两组合,可以形成4种不同的激发波长,正好分别用于激发A、G、C、T 4种碱基。
Cluster上所标记的荧光基团在激光激发下产生的信号,可以用相机拍摄或者扫描的方式收集信号。扫描技术速度比较快,被X10系列采用。由于FC面积比较大,而且上表面和下表面要分别拍照,所以拍照过程相当耗时。对于经典的HiSeq 2000来说,一次测序循环所产生的荧光信号,需要大约40分钟的时间才能拍照收集完毕,时间比测序反应本身还要长。
3 剪切
荧光信号收集完毕后,关闭激光,用剪切剂去除测序引物的延伸产物上的碱基所标记的荧光基团和终止基团。两个修饰基团均被切除,一方面消去干扰荧光,一方面使链末端的碱基回复到自然的可延伸状态,为下一轮测序做好准备。
再重复合成、激发、收集等步骤,即可进行第二个碱基的测序。
测序循环可以重复多次。理论上可以一直重复,直到信噪比降低得无法有效识别碱基信号为止。由于荧光基团的发光效率持续不断在衰减,Taq酶的活性也在持续不断地衰减,所以实际上测序循环次数是有限的,大重复次数与sbs试剂的配方有关。测序的循环次数可以在软件设置过程中人为,这个重复次数就是每个测序片段的读长。目前,Illumina平台的读长有2x100 bp,2x125 bp,2x150 bp,2x300 bp等多种,其中2x150 bp用得较广泛。
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illumina品牌 SR-50-705002-00 BlueGnome professional services (Regional)
illumina品牌 SR-50-705003-00 BlueGnome professional services (ROW)
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illumina品牌 SV-500-1001 Service Parts and Labor Estimate
illumina品牌 SV-800-1000 Service Contract Upgrade
illumina品牌 TR-203-0021 Instrument Field Service Training
illumina品牌 TR-203-0022 Instrument Field Service Training Recertification
单端测序:单端测序(Single-read)首先将DNA样本进行片段化处理形成200-500bp的片段,引物序列连接到DNA片段的一端,然后末端加上接头,将片段固定在flow cell上生成DNA簇,上机测序单端读取序列。
双端测序:双端测序(Paired-end)方法是指在构建待测DNA文库时在两端的接头上都加上测序引物结合位点,在*轮测序完成后,去除*轮测序的模板链,用对读测序模块(Paired-End Module)引导互补链在原位置再生和扩增,以达到第二轮测序所用的模板量,进行第二轮互补链的合成测序。
基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。
基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术,是下一个改变世界的技术 。
基因测序只是基因检测的方法之一,其又叫基因谱测序,是上*的一种基因检测标准。
基因测序广为人知的还有针对唐氏综合征筛查的无创产前基因检测。只需要采集孕妇的外周血,通过对血液中游离DNA(包括胎儿游离DNA)进行测序,并将测序结果进行生物学分析,从而得出胎儿是否患有染色体数目异常的疾病,包括常见的21-三体综合征(唐氏综合征)、18-三体综合征(爱德华氏综合征)和13-三体综合征(Patau综合征)。
基因组文库是指将某生物的全部基因组DNA切割成一定长度的DNA 片段克隆到某种载体上而形成的集合。基因组文库根据DNA 来源又分为核基因组文库、叶绿体基因组文库及线粒体基因组文库。基因组文库构建时遗传信息供体是基因组DNA,因而无发育时期及组织器官特异性,在一个*的基因组文库中包含着基因组DNA 上的所有编码区及非编码区序列的克隆; 生物有机体的每一个基因在文库中都有其克隆,该克隆的基因片段里包括着间隔序列,所以基因组文库可真实地显示基因组的全部结构信息。
基因组文库(Genomic Library)定义:把某种生物基因组的全部遗传信息通过克隆载体贮存在一个受体菌克隆子群体中,这个群体即为这种生物的基因组文库。
cDNA文库:以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。cDNA文库特异地反映某种组织或细胞中,在特定发育阶段表达的蛋白质的编码基因,因此cDNA文库具有组织或细胞特异性。
cDNA文库是以特定的组织或细胞mRNA为模板,逆转录形成的互补DNA(cDNA)与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌形成重组DNA克隆群,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织或细胞的cDNA文库。cDNA文库特异地反映某种组织或细胞中,在特定发育阶段表达的蛋白质的编码基因,因此cDNA文库具有组织或细胞特异性。
cDNA文库显然比基因组DNA文库小得多,能够比较容易从中筛选克隆得到细胞特异表达的基因。但对真核细胞来说,从基因组DNA文库获得的基因与从cDNA文库获得的不同,基因组DNA文库所含的是带有内含子和外显子的基因组基因,而从cDNA文库中获得的是已经过剪接、去除了内含子的cDNA。
真核生物基因组DNA十分庞大,其复杂程度是蛋白质和mRNA的100倍左右,而且含有大量的重复序列. 采用电泳分离和杂交的方法,都难以直接分离到目的基因.这是从染色体DNA为出发材料直接克隆目的基因的一个主要困难。
高等生物一般具有10^5种左右不同的基因,但在一定时间阶段的单个细胞或个体中,都仅有15%左右的基因得以表达,产生约15000种不同的mRNA分子.可见,由mRNA出发的cDNA克隆,其复杂程度要比直接从基因组克隆简单得多。
cDNA文库在研究具体某类特定细胞中基因组的表达状态及表达基因的功能鉴定方便具有特殊的优势,从而使它在个体发育、细胞分化、细胞周期调控、细胞衰老和死亡调控等生命现象的研究中具有更为广泛的应用价值,是研究工作中较常使用到的基因文库。
产品名称:illumina Nextera DNA文库制备试剂盒 (24 samples) 产品货号:FC-121-1030
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