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华雅旗下 红荣微再(上海)生物工程技术有限公司 授权代理Rubicon Genomics 文库制备试剂 R400407/RB4407为期货详询 红荣微再-客服 经销商专员
ThruPLEX DNA-seq以pg级微量DNA作为起始样本构建文库,特别设计接头免去了中间纯化步骤,简化了文库制备流程,整个实验只需15分钟手动操作且为1个反应管、2个小时、3步反应的简单过程。尤其适合少量细胞起始的ChIP测序。
Rubicon ThruPLEX DNA-seq Kit
NGS新一代测序微量样本DNA文库制备试剂
英文名称:ThruPLEX DNA-seq 96D Kit
中文名称:DNA测序文库制备试剂
货号:R400407或RB4407(旧货号)
品牌:Rubicon Genomics
加样量 50 pg - 50 ng
反应时间 2小时
手动操作 15 min
操作步骤 3步
类型 完整试剂盒,包含illumina测序索引(indexes)
适合样本 所有打断的双链DNA
ThruPLEX DNA测序文库制备试剂基于ThruPLEX化学技术制备DNA文库,文库的多重测序能力提高,具有更高多样性。试剂zui高包含96个illumina兼容索引(indexes)。ThruPLEX DNA测序文库制备试剂可用于DNA/RNA 测序和ChIP测序,并与主流目标区域富集平台兼容。
ThruPLEX DNA-seq应用
全基因组测序(WGS)
全外显子组测序(WES)
靶向测序
染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)
RNA-seq
应用特别介绍:ChIP-seq
ChIP-seq引用文献:2016至今有11篇ThruPLEX用于ChIP-seq 的高影响因子文章发表。
简单的工作流程:3个反应步骤在一个管内进行,只需2h,手动操作15min
模板修复—末端连接—扩增
组份:
分模板准备、文库合成和文库扩增三大部分。保存-20℃。
模板准备缓冲液+模板准备酶(红色)
文库合成缓冲液+文库合成酶(黄色)
文库扩增缓冲液+文库扩增酶(绿色)
Illumina索引(indexing) 试剂(蓝色)
无核酸酶水(无色)
ThruPLEX DNA-seq特点
高灵敏度、高性能:以低至50 pg至50 ngDNA为起始材料,尤其适合ChIP-DNA
快速简便的工作流程:单管或单孔3步操作,2小时,无需转移操作
可重复的结果:构建文库具有高多样性、低重复度和GC偏差
完整的文库构建试剂:优化的illumina index引物和接头试剂、酶、缓冲液及无核酸酶水
兼容主流目标区域富集平台:Agilent SureSelect®, Roche Nimblegen® SeqCap® EZ及 IDT xGen® Lockdown® probes
ThruPLEX技术—茎环形 接头
茎环形接头的特别设计,能够有效抑制二聚体的形成,免去了大多数Illumina等文库制备技术需要的中间纯化和样品转移步骤。整个实验只需15分钟手动操作且为1个反应管、2个小时、3步反应的简单过程。仅在PCR反应后进行1次磁珠纯化,纯化造成的样品损失低,可对珍贵样品进行有效分析。
茎环形接头的设计降低实验背景,免去了中间纯化步骤。
ThruPLEX DNA-seq 制备文库高多样性 低重复度 低GC偏差
ThruPLEX DNA-seq Kit 优于其他NGS文库制备试剂。与其他试剂相比,ThruPLEX DNA-seq Kit可以更少的起始DNA,构建多样性更好(左图),重复更少(右图)的文库(25 M read pairs)。NGS文库分别采用图示对照gDNA起始量,以相应的文库制备试剂制备,采用MiSeq v3 flow cell测序。
ThruPLEX DNA-seq Kit 减少了GC偏差。以人类基因组相对覆盖度为GC含量(%)的函数(50 ng DNA起始)。(左图)ThruPLEX DNA-seq Kit 在整个范围内都有出色的覆盖。(右图)ThruPLEX DNA-seq Kit (金色)与参试的其他试剂一样好或更好。请注意,在这些图中的覆盖度应该为1。人类基因组中的GC含量分布以红色柱形图表示。
自备试剂:
Agencourt®XP 核酸纯化磁珠(Beckman Coulter,目录号A63880)
引用文献:
2017年以来,谷歌学术上搜索Rubicon ThruPLEX DNA-seq 有94篇文献。
背景介绍
新一代测序(英文名称Next Generation Sequencing,缩写NGS)是一个需求快速发展的动态领域。无论样品类型或应用如何,每个样品都需要制备DNA文库,以便在Illumina NGS平台上进行测序。
文库制备过程(下图)涉及将Illumina测序接头与片段DNA连接并添加Illumina兼容索引(indexes)以允许多个样本的流动池混合测序(多重平行测序)。文库制备是NGS操作流程的关键步骤,并直接影响测序结果的质量。
随着NGS临床应用的出现以及随着NGS测序仪器功能的日益强大,研究人员和临床医师正在越来越多地调查更加困难和具有挑战性的样品,这些样品数量有限,使用量少,有的还受损。在许多应用中,例如来自血浆的游离DNA,样品DNA材料有限且高度降解。
在DNA样本比较珍贵时,例如肿瘤组织的分析,使用少量样本的能力可以尽可能多的保存样本用于多种用途。临床样品还需要仔细追踪样品,样品从不离开试管的方案有利于确保准确的样品追踪并避免污染。这种不断增长的趋势需要文库制备试剂盒,它能够以简单的工作流程精确地保留样本的复杂性并提供更高的灵敏度和更高的多重测序能力。
满足这些需求是ThruPLEX DNA测序试剂的核心。它的开发旨在提高多重测序能力,并从少量样本制备高品质、兼容Illumina的NGS文库。ThruPLEX DNA-seq的三步式单管文库制备是业界zui简单的操作流程,可zui大限度地减少处理错误和宝贵样品的损失。
名词解释:ChIP-seq 结合DNA测序分析蛋白与DNA的相互作用,确定DNA相关蛋白的结合位点。
ChIP:染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法。
ChIP测序也称为ChIP-seq,是一种用于分析蛋白质与DNA相互作用的方法。 ChIP-seq将染色质免疫沉淀(ChIP)与大规模平行DNA测序相结合,以确定DNA相关蛋白的结合位点。它可以用来精确地定位任何目标蛋白质的结合位点。
ThruPLEX DNA-seq订购信息
R400407/RB4407为期货
品牌 | 货号 | 名称 | 规格 | 旧货号 |
Rubicon | R400407 | ThruPLEX DNA-seq 96D Kit | 96 次 | RB4407 |
其他规格 |
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Rubicon | R400406 | ThruPLEX DNA-seq 48D Kit | 48 次 | RB4406 |
Rubicon | R400427 | ThruPLEX DNA-seq 48S Kit | 48 次 | RB4427 |
Rubicon | R400428 | ThruPLEX DNA-seq 12S(48) Kit | 48 次 | RB4428 |
Rubicon | R400523 | ThruPLEX DNA-seq 6S(12) Kit | 12 次 | RB4523 |
Rubicon公司成立于2000年,总部位于美国密歇根州。产品都拥有技术,检控严格,拥有cGMP级生产能力,是单细胞测序文库构建的。2017年1月,Rubicon 成为Takara的一员,并且发展良好。
华雅再生医学旗舰公司:红荣微再(上海)生物工程技术有限公司主营细胞治疗和精准医疗等产品,2018年与TAKARA继续合作,授权代理(上海)其旗下Rubicon单细胞文库构建试剂等产品。
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