illumina TSACP癌症基因组靶向测序建库

• 型   号：FC-130-1008
• 价   格：240000

illumina TSACP癌症基因组靶向测序建库通过高度多重靶向重测序方法，用于检测癌症基因组数百个突变热点中的体细胞突变。可以用于临床快速高效地发现、验证和筛选癌症相关遗传变异。
特点：
提供预先设计的，优化的寡核苷酸探针，用于测序大于35千碱基（kb）的靶基因组序列中的突变热点。
在高度多重的单管反应中，用212个扩增子靶向48个基因。
两天完成泛癌基因组体细胞突变靶向重测序扩增子建库

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两天完成泛癌基因组体细胞突变靶向重测序扩增子建库

TruSeq Amplicon - Cancer Panel

英文名称：TruSeq® Amplicon - Cancer Panel，缩写TSACP

中文名称：TruSeq 扩增子法癌症Panel

用途：癌症基因组体细胞突变扩增子建库试剂盒，适用于FFPE样本。

TruSeq Amplicon - Cancer Panel 提供预先设计的、优化的寡核苷酸探针，富集212个扩增子来检测48个癌症相关基因中的突变区域。

TruSeq Amplicon - Cancer Panel能够对包括BRAF，KRAS和EGFR在内的重要癌症相关基因进行高度敏感的突变分析。这些基因突变与许多癌症有关，包括黑色素瘤，结直肠癌，卵巢癌和肺癌。这种检测方法从珍贵的FFPE样品筛选这些重要变异的*能力将从多种肿瘤中解开大量基因组信息。

The TruSeq Amplicon - Cancer Panel enables highly sensitive mutation detection studies of important cancer-related genes, including BRAF, KRAS, and EGFR. Mutations in these genes are linked to many cancers, including melanoma, colorectal, ovarian, and lung cancer.

TSACP特点

提供预先设计的，优化的寡核苷酸探针，用于测序> 35千碱基（kb）的靶基因组序列中的突变热点。

在高度多重的单管反应中，用212个扩增子靶向48个基因。

对来自选定基因（如BRAF，KRAS和EGFR）的数百个癌症热点进行测序。

两天内完成基因组DNA的全面分析数据。

zui准确的数据能够可靠地检测低于5％的突变频率。

使用简单的仪器上自动分析软件对所有样品进行变异调用和分析。

TSACP应用

泛癌分析：快速高效地发现、验证和筛选癌症相关遗传变异。

TSACP参数

分析时间 8 hours

手动操作 3.5 hours

加样量 150 ng high-quality genomic DNA, 250 ng FFPE genomic DNA

测序仪 MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx in Research Mode

核酸 DNA

特别样本 FFPE Tissue 福尔马林固定包埋组织

突变类型Insertions-Deletions (indels), Somatic Variants

种属 人

癌症类型 Pan-Cancer 泛癌

方法 扩增子测序 靶向基因测序Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing

TSACP适用样本

高质量基因组DNA：250ng（推荐），150ng（zui低）

FFPE基因组DNA：250ng （zui低）

简化的操作流程

TSACP将一些操作流程简化，包括FFPE样品的DNA质量控制分析，简单磁珠样品标准化，自动化簇生成和双端测序以及仪器上的数据分析。利用MiSeq系统的长双端读取能力，速度和高数据质量，现在可以在几天内完成整个项目，而不是几个月。

样本质控—样本目标基因的扩增子获得—扩增子测序和分析

扩增子获得流程：

一对寡核苷酸用来获得一个扩增子。将这些寡核苷酸杂交至未片段化的基因组DNA（96孔板），随后进行延伸和连接以形成DNA模板（带引物序列的目标区域）。使用随试剂盒提供的索引接头，文库被索引，PCR扩增，然后在测序之前pool到单个试管中。

A癌症panel寡核苷酸探针的杂交

B延伸和连接

C通过PCR添加索引（indexes）和测序接头

D收获准备测序的扩增子

TSACP性能规格

Panel 大小35 kb；内容 212 amplicons；扩增子大小 170–190 bp；DNA Input 250 ng

Assay Time < 7 hrs, 2.5 hrs hands-on；Enrichment Specificity > 85%；Coverage Uniformity > 85% at 0.2× mean

Dropouts* 0 （Dropouts are defined as amplicons having no sequencing coverage when the sample achieves a mean sequencing depth of > 1000×.）

TSACP目标基因列表

名词解释：Pan-Cancer（泛癌）

基因组图谱泛癌计划：由于起源部位、细胞类型、基因突变形式的不同,肿瘤可表现出不同的形态。这些因素同时影响肿瘤的治疗效果。虽然已经证实许多基因的改变直接导致了表型的改变,然而,许多肿瘤谱系中复杂分子机制依然未*阐明。因此,肿瘤基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）研究网络分析了大量人类肿瘤,以期发现DNA、RNA、蛋白质和表观遗传学水平的分子改变。含丰富数据的结果给我们提供了一个机会,对整个肿瘤谱系的共性、个性及新观点形成一个整体描绘。基因组图谱泛癌计划zui先比较了12种肿瘤类型。对不同肿瘤分子改变及其功能的分析,未来会告诉我们如何将有效的治疗方法应用于类似基因表型的肿瘤。

TruSeq Amplicon - Cancer Panel Kit 组件 (FC-130-1008)：

四个试剂盒包括两个Pre-Amplification、一个Post-Amplification和一个TruSeq Amplicon - Cancer Panel Oligo Kit, Pre-Amplification试剂盒。

TSACP订购信息

TSACP搭配试剂：

Illumina FFPE QC Kit WG-321-1001

TruSeq Custom Amplicon Index Kit (96 indices, 384 Samples) FC-130-1003

MiSeq Reagent Kit (300-cycles - PE) MS-102-2002

可选: TruSeq Index Plate Fixture and Collar Kit (2 Each) FC-130-1007

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