产品中心
华雅旗下红荣微再授权代理TAKARA Rubicon 文库构建(illumina平台)产品
Rubicon ThruPLEX® Plasma-seq Kit
ThruPLEX与所有Illumina平台兼容
产品英文名称:ThruPLEX® Plasma-seq Kit
产品中文名称:血浆来源cell free DNA NGS文库构建试剂
样本:血浆来源的cfDNA(cell free DNA)和ctDNA(循环肿瘤DNA)
用途:WGS,WES,靶向测序,ctDNA分析
ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技术,并用于血浆来源cfDNA高品质NGS文库(illumina平台)构建。
该试剂专门针对cell-free DNA进行优化,在保持样本GC代表性的基础上,提升了文库的信息容量。文库构建后可用于CNV分析、全基因组测序分析或是采用一些panel针对目标区域进行捕获富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。
血浆样品采用ThruPLEX Plasma-seq试剂盒制备文库,能有更好的灵敏度、更准确的基因变异分析结果。与其它液体活检的样品一样,血浆由于其易获得、价值高的特点,深受研究肿瘤学或者孕妇血浆中胎儿游离DNA科研工作者的重视。
产品特点
专为cfDNA设计:修复及连接试剂配方更新,方法优化
高品质NGS文库:在宽广的GC含量范围内,可以达到高检测再现性
起始量范围广:<1 ng到30 ng cfDNA量
快速简便:单管、2小时、3步操作步骤,无需纯化或样品转移步骤
应用领域:液体活检、ctDNA、靶向测序等领域文库构建
兼容自动化平台:Beckman® FXP Workstation
ThruPLEX与所有Illumina平台兼容
Designed for cell-free DNA: newly formulated repair and ligation reagents with optimized protocols
High performance NGS libraries: high diversity with broad and reproducible GC coverage
Variable sample input: <1 ng to 30 ng of cell-free DNA
Fast and simple workflow: 3 steps in a single tube or well in 2 hours with no purification or sample transfer steps
Research applications: libraries from samples where results require high sensitivity including liquid biopsies, ctDNA, and targeted sequencing
Automation-friendly: Beckman® FXP Workstation
产品应用
WGS,WES,靶向测序,ctDNA分析
cfDNA文库构建,肿瘤及产前无创检测(母体血浆中胎儿游离DNA分析)
ThruPLEX Plasma-seq 优化用于cell-free DNA等液体活检样品
液体活检样品包括
循环核酸
– Cell-free DNA (cfDNA)
• 循环肿瘤DNA(ctDNA)占一小部分
及RNA 外泌体等
ThruPLEX技术原理
ThruPLEX技术和所有Illumina NGS平台兼容。
技术要点:茎环形接头
茎环形接头的特别设计,免去了大多数Illumina等文库制备技术需要的中间纯化和样品转移步骤。整个实验只需15分钟手动操作且为1个反应管、2个小时、3步反应的简单过程。仅在PCR反应后进行1次磁珠纯化,纯化造成的样品损失低,可对珍贵样品进行有效分析。
产品使用
适用样本:液体活检样本
1ng-30ng 血浆、尿液来源的cfDNA
组份
分模板准备、文库合成和文库扩增三大部分。保存-20℃。
Template Preparation Buffer 模板准备缓冲液(红色)
Template Preparation Enzyme 模板准备酶(红色)
Library Synthesis Buffer文库合成缓冲液(黄色)
Library Synthesis Enzyme文库合成酶(黄色)
Library Amplification Buffer文库扩增缓冲液(绿色)
Library Amplification Enzyme文库扩增酶(绿色)
Nuclease-Free water 无核酸酶水(无色)
Indexing 试剂(蓝色)
咨询 1500 1904 520 红荣微再-客服: 经销商专员
自备材料:
PCR管或96孔PCR板和密封件
Low binding aerosol barrier tips
新鲜制备的80%(v / v)乙醇
Agencourt® AMPure® XP 磁珠(Beckman Coulter,目录号A63880)
可选试剂:
KAPA®Library Quantification Kit – Illumina (Kapa Biosystems, CAT. NO. specific to real time PCR system used)
EvaGreen® Dye (20X in water, Biotium, CAT. NO. 31000-T)
Fluorescein Calibration Dye (Bio-Rad Laboratories
简单的工作流程:一管反应
样品加入PCR管。
准备模版修复混合液1(红盖),加入PCR管,反应。
准备文库合成混合液2(黄盖),加入PCR管,反应。
准备文库扩增混合液3(绿盖),加入PCR管,反应。
产品性能
高cell-free DNA文库多样性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit构建的文库,具有高的多样性和低的duplicates和unmapped reads。图中表示cfDNA分别提取于3份血浆样品,文库定量采用Qubit荧光定量。Bioanalyzer测定mononucleosomal DNA在各样品的量分别为0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式测序,且每个文库产生17 M到25 M reads。每个文库在down-sampling数据至17 M reads以后,计算Duplication rates。
Rubicon R400490/R400491/R400492 订购信息
货号 | 名称 | 规格 | 价格 |
R400490 | ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit | 12 Rxns | ¥9109 |
R400491 | ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit | 48 Rxns | ¥31533 |
R400492 | ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit | 96 Rxns | ¥56760 |
Rubicon公司成立于2000年,总部位于美国密歇根州。产品都拥有技术,检控严格,拥有cGMP级生产能力,是单细胞测序文库构建的。2017年1月,Rubicon 成为Takara的一员,并且发展良好。
华雅再生医学旗舰公司:红荣微再(上海)生物工程技术有限公司主营细胞治疗和精准医疗等产品,2018年与TAKARA继续合作,授权代理(上海)其旗下Rubicon单细胞文库构建试剂等产品。