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华雅旗下红荣微再授权代理TAKARA Rubicon单细胞扩增文库构建产品
欢迎您致电 华雅再生医学旗舰公司:红荣微再(上海)生物工程技术有限公司 181 6644 1624。红荣微再-客服: 1022 355 724
Rubicon-ThruPLEX® DNA-seq Kit
产品英文名称:ThruPLEX® DNA-seq Kit
产品中文名称:Illumina测序文库构建试剂盒
用途:WGS,WES,靶向测序,ChIP-seq,RNA-seq
保存:-20ºC
ThruPLEX DNA-seq Kit 基于新的ThruPLEX 技术,可以低至50 pg的DNA起始构建DNA文库,在提高灵敏度的同时可以构建多达96种illumina index引物文库。本试剂适用于多种样品来源的片段化DNA样品,基因组DNA或体液样品如游离DNA,FFPE样品来源DNA和cDNA。ThruPLEX DNA-seq Kit 整体流程可以在单管或单孔中进行,约2个小时即可完成,无需纯化或样品转移步骤。试剂盒提供12、48或96种Illumina单端或双端index引物,该系列引物保存在反应管中(6或12)或预分装密封于条形码标记的微孔板中。ThruPLEX DNA-seq Kit 可以用于DNA-seq,RNA-seq,ChIP-seq,并且可以兼容主流平台实现强有力的目标区域富集。
ThruPLEX® DNA-seq Kit builds on the innovative ThruPLEX chemistry to generate DNA libraries from as little as 50 pg of DNA and increases sensitivity while providing up to 96 indexes for multiplexing. This kit can be used with fragmented DNA from any sample source – genomic, biofluids such as cell-free DNA, DNA from FFPE materials and cDNA. The entire ThruPLEX DNA-seq Kit workflow is performed in a single tube or well in about 2 hours and requires no purification steps or sample transfers. Kits contain 12, 48 or 96 single- or dual-read Illumina-compatible indexes either in tubes (6 or 12) or pre-dispensed and sealed in barcoded microplates. ThruPLEX DNA-seq Kit can be used in any DNA-seq application, RNA-seq, ChIP-seq and offers robust target enrichment performance with all of the leading platforms.
产品特点
高灵敏度、高性能:以低至50 pg至50 ngDNA为起始材料
完整的文库构建试剂:优化的illumina index引物和接头试剂、酶、缓冲液及无核酸酶水
快速简便的工作流程:单管或单孔3步操作,2小时,无需转移操作
兼容主流目标区域富集平台:Agilent SureSelect®, Roche Nimblegen® SeqCap® EZ及 IDT xGen® Lockdown® probes
ThruPLEX与所有Illumina平台兼容
产品应用
WGS(全基因组测序),WES(全外显子组测序),靶向测序,ChIP-seq,RNA-seq
ChIP-seq应用特别介绍
ChIP-seq引用文献
2016至今有11篇ThruPLEX用于ChIP-seq 的高影响因子文章发表。
• 应用领域
– 发育和干细胞生物学
– 肿瘤研究
ChIP-seq–分析蛋白与DNA的相互作用,确定结合位点
• 很多实验涉及活检样品和稀有细胞群(干细胞,原代细胞等)
• 主要的挑战是以微量DNA样品构建NGS文库
ThruPLEX技术原理
技术要点:茎环形接头
茎环形接头的特别设计,免去了大多数Illumina等文库制备技术需要的中间纯化和样品转移步骤。整个实验只需15分钟手动操作且为1个反应管、2个小时、3步反应的简单过程。仅在PCR反应后进行1次磁珠纯化,纯化造成的样品损失低,可对珍贵样品进行有效分析。
简单的工作流程:一管反应
产品使用
组份:
分模板准备、文库合成和文库扩增三大部分。保存-20℃。
Template Preparation Buffer 模板准备缓冲液(红色)
Template Preparation Enzyme 模板准备酶(红色)
Library Synthesis Buffer文库合成缓冲液(黄色)
Library Synthesis Enzyme文库合成酶(黄色)
Library Amplification Buffer文库扩增缓冲液(绿色)
Library Amplification Enzyme文库扩增酶(绿色)
Nuclease-Free water 无核酸酶水(无色)
Indexing 试剂(蓝色)
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自备试剂:
PCR管或96孔PCR板和密封件
低吸附滤芯枪头
新鲜制备的80%(v / v)乙醇
Agencourt®XP 核酸纯化磁珠(Beckman Coulter,目录号A63880)
可选试剂:
KAPA®Library Quantification Kit-Illumina (Kapa Biosystems, CAT. NO. specific to real time PCR system used)
EvaGreen® Dye, 20X in water (Biotium, CAT. NO. 31000-T)
Fluorescein Calibration Dye (Bio-Rad Laboratories,)
产品性能
ThruPLEX DNA-seq Kit 优于其他NGS文库制备试剂。与其他试剂相比,ThruPLEX DNA-seq Kit可以更少的起始DNA,构建多样性更好(左图),重复更少(右图)的文库(25 M read pairs)。NGS文库分别采用图示对照gDNA起始量,以相应的文库制备试剂制备,采用MiSeq v3 flow cell测序。
ThruPLEX DNA-seq Kit 减少了GC偏差。以人类基因组相对覆盖度为GC含量(%)的函数(50 ng DNA起始)。(左图)ThruPLEX DNA-seq Kit 在整个范围内都有出色的覆盖。(右图)ThruPLEX DNA-seq Kit (金色)与参试的其他试剂一样好或更好。请注意,在这些图中的覆盖度应该为1。人类基因组中的GC含量分布以红色柱形图表示。
订购信息
货号 | 名称 | 规格 | 价格 |
R400406 | ThruPLEX DNA-seq 48D Kit | 48 Rxns | ¥28314 |
R400407 | ThruPLEX DNA-seq 96D Kit | 96 Rxns | ¥50596 |
R400427 | ThruPLEX DNA-seq 48S Kit | 48 Rxns | ¥28314 |
R400428 | ThruPLEX DNA-seq 12S(48) Kit | 48 Rxns | ¥28314 |
R400523 | ThruPLEX DNA-seq 6S(12) Kit | 12 Rxns | ¥7963 |
Rubicon公司成立于2000年,总部位于美国密歇根州。产品都拥有技术,检控严格,拥有cGMP级生产能力,是单细胞测序文库构建的。2017年1月,Rubicon 成为Takara的一员,并且发展良好。
华雅再生医学旗舰公司:红荣微再(上海)生物工程技术有限公司主营细胞治疗和精准医疗等产品,2018年与TAKARA继续合作,授权代理(上海)其旗下Rubicon单细胞文库构建试剂等产品。