Paxgene采集管在妊娠期间细胞动态的检测中的应用
更新时间：2023-10-27 点击次数：545次
人类血液是分子信息的丰富来源，可用于开发特定肿瘤和器官（例如胎盘）的非侵入性液体活检，以预测疾病、其进展和对治疗的反应。近年来，随着微阵列和RNA测序（RNA-Seq）等技术的普及，全基因组转录组分析被应用于发现分子标记，这些技术允许同时测量数以万计的蛋白质编码和非蛋白质。开发血液转录组标记物以监测整个怀孕期间的胎盘功能和产科并发症的风险需要准确量化基因表达。
来自美国韦恩大学医学院和密歇根州立大学的研究团队在Nature子刊Scientific Reports发表了题为“Targeted expression profiling by RNA - Seq improves detection of cellular dynamics during pregnancy and identifies a role for T cells in term parturition"的文章，比较了在外显子水平探测转录组的Affymetrix人类转录组阵列（HTA 2.0）、具有珠蛋白还原的配对末端Illumina RNA-Seq以及一种新型全基因组靶向表达分析技术 DriverMap，评估了这些方法在母体全血中定量源自胎盘单细胞基因组的细胞类型特异性特征表达的能力，并确定了这些特征是否能表明足月分娩。
由于器官和/或细胞类型特异性转录本在全血中低表达，因此RNA的完整性、稳定性和RNA的丰度定量对下游实验至关重要。本研究中使用的血液RNA采血管是PAXgene全血RNA管（BD，762165），该管中含有稳定添加剂，可长时间维持细胞 RNA 完整性。
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