二代测序 QC 全流程,快来看看适合你的QC方案!!!
阅读:29发布时间:2020/12/21
二代测序(NGS)的建库流程是很长很复杂的,建库的每一步都建立在前一步的基础上,因而质量控制(QC)显得尤为重要。无论您的初始样本类型是什么,在整个实验流程中,确保靶标的完整性、大小和集中程度是构建高质量文库,进而获得准确、可重复的结果的关键。为了帮助您更好地确定实验流程,安捷伦汇总了各类初始样本的各种建库流程。
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测序过程中的关键 QC 步骤
Fragmentation
片段化是将样本剪切成更小的片段的过程。可以通过酶切或超声的方法来实现。QC 是这里的一个重要步骤,以确保片段化的条件是合适的。
Ligate adaptors
接头是已知的寡核苷酸序列,用于连接到未知的目标测序片段,提供测序引物结合区和样本识别码。接头连接后的 QC 可以确保接头成功连接到 DNA。
Size selection
片段筛选的目的是去掉多余的引物和接头序列,获得需要的目标序列。QC 在这一步是至关重要的,可以确保后留下的是目标大小和足够浓度的文库。
Normalize/pool
在文库制备结束时,必须对样本进行量化,以确定要加载到测序仪上的文库量。如果需要多个文库混合上机测序,QC 可以帮助提供稀释指导,确保加载到测序仪上的文库是均匀的,有利于提高数据的均一性。
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现货产品:
Partnumber | Description |
G2939BA | 2100 生物分析仪 |
5067-1505 | DNA 1000 Reagents |
5067-4626 | High Sensitivity DNA Kit |
G2991AA | 4200 TapeStation 系统 |
G2992AA | 4150 TapeStation 仪器 |
5067-5582 | D1000 ScreenTape |
5067-5583 | D1000 Reagents |
5067-5586 | D1000 Ladder |
5067-5584 | High Sensitivity D1000 ScreenTape |
5067-5585 | High Sensitivity D1000 Reagents |
5067-5587 | High Sensitivity D1000 Ladder |
5067-5365 | Genomic DNA ScreenTape |
5067-5366 | Genomic DNA Reagents |
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