Streck品牌cfDNA采血管可实现全血采集样品中cfDNA规范化(标准化)。可用于无创产前基因筛查/无创产前基因检测(NIPS/NIPT)和液体生物监测(液体活检,Liquid Biopsy)的规范化,提高检验结果的准确性。
1. 时间稳定性(Time Stability)
CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集的全血,其Cell-free DNA可以在室温(22⁰C) 下能稳定保存长达28天!
结论来自如下监测:在不同时间下,对室温保存在CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes中的血液,取血浆使用droplet digital PCR检测β-Actin基因片段,用以反映cell-free DNA浓度,发现与初始采集时比较,保存长达28天后该基因没有发生显著改变。而K3EDTA采血管无法实现在室温下的长时间保存。在第3天,β-Actin已经呈现显著升高,cell-free DNA浓度持续升高,至28天时,浓度升高上千倍之多。
2. ctDNA稳定性
Blood Exo DNA ProTeck® tubes保存血样,血液中的肿瘤DNA室温(22⁰C)稳定保存28天。
该结果来自于对野生型KRAS DNA浓度的检测:Blood Exo DNA ProTeck® tubes能让血液中的KRAS DNA室温(22⁰C)稳定保存28天,而K3EDTA保存管无法实现。
将来源于细胞系的已知量的KRAS外显子2 G13D突变的肿瘤cell-free DNA作为内参照加入到采集的血样中,使用therasreen KRAS RGQ PCR试剂盒和Rotor Gene real time PCR仪检此内参。在K3EDTA采血管保存的血样中,发现仅在采集日可以检出,而Blood Exo DNA ProTeck® tubes中保存的血样,22°C下保存28天依旧可以检出。
3. 温度稳定性(Temperature stability)
使用CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集的全血在4⁰C到30⁰C间都能保持cell-free DNA稳定。
无论使用Qubit® dsDNA HS检测法,还是使用droplet digital PCR检测RASSF1A,在CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes中,6⁰C, 22⁰C或37⁰C三种保存温度下保存的血液,直到第7天cell-free DNA浓度都没有显著改变。
4. 运输稳定性(Shipping stability)
使用CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集保存的血样能经受42⁰C温度,不影响血中cell-free DNA浓度。
实验方法:将ProTeck采血管采集的血样,通过FedEx运输往哥伦比亚,亚利桑那等地,经受两天42⁰C,与室温保存的样品比较cell-free DNA浓度没有显著改变,而在K3EDTA管中保存的血样cell-free DNA浓度显著升高(droplet digital PCR技术检测β-Actin基因片段)。
5.甲醛检测
NMR检测显示CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tube不含甲醛。