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技术支持

Picoplex:植入前基因筛查诊断单细胞文库构建技术
更新时间:2018-03-12   点击次数:3200次

微阵列(arrays)分析是zui广泛使用的PGS技术。

PicoPLEX全基因组扩增技术已经成为PGS的标准扩增技术。

 

植入前基因筛查和诊断(PGS,PGD)指体外受精(IVF)过程中所做的胚胎或卵母细胞测试,以便选择没有染色体变异或带有家族遗传疾病等位基因的胚胎,提高怀孕成功率,降低特定遗传病的传递风险。微阵列分析是IVF机构zui常用的PGS技术,应用PicoPLEX技术的好几种试剂盒被广泛使用。包括Illumina’s 24Sure 微阵列(原 BlueGnomes 24Sure), Perkin Elmer’s KaryoLite BoBs developed for PGS和 Oxford Gene Technology’s CytoSure 微阵列。不过实验室研究趋向是使用低深度的新一代测序(NGS)替代微阵列,PicoPLEX DNA-seq正好满足这种需求。

 

植入前基因筛查诊断流程

首先从受精卵吸取一个极体或者从受精后第三天的5到10个胚胎细胞吸取单细胞。裂解细胞后,释放出来的DNA进行扩增,所得产物标记后与含有目标基因组的微阵列杂交。分析软件会识别出拷贝数变异。具有高稳定性和可再现性,PicoPLEX全基因组扩增技术已经成为PGS的标准扩增技术。这一技术也适用任何单细胞样品和皮克级纯化DNA的基因特征分析。

 

胚胎细胞(极体 卵裂 囊胚)——PicoPLEX试剂(裂解扩增DNA)——微阵列杂交——染色体变异分析

 

PicoPLEX技术

PicoPLEX使用非互补引物进行随机引物延伸,所得文库系统偏差高,而随机偏差极低。

引物特点:随机引物延伸和非互补引物

文库特征:高系统偏差 低随机偏差

* US patent 7,803,550 and EP1924704

 

PicoPLEX® WGA Kit

植入前基因筛查(PGS)PicoPLEX®单细胞扩增试剂盒

从单细胞中扩增DNA构建高重复性的文库现在成为可能PicoPLEX WGA kit采用技术,设计、优化用于从单细胞中扩增单拷贝基因组DNA起始量低至单细胞或6pg基因组DNA。便捷的单管操作流程减少失误,节省时间并降低反应背景

PicoPLEX WGA Kit兼容微阵列比较基因组杂交(array CGH)分析及PCR平台,试管婴儿行业供应商如BlueGnome信赖并用于PGS/PGD

 

 

操作流程

 

单管,三步。1PCR管或微孔中3个小时即可完成。无需样品纯化和转移过程,降低了样品损失,避免了操作污染和操作误差。

 

单细胞扩增再现性良好

 

肿瘤细胞流式细胞分选,采用PicoPLEX WGA Kit 扩增。每个细胞(蓝色曲线)扩增比率相同,并且预期产量相同。不含细胞的样品(绿色曲线;空白模板对照)显示非常低的背景。

适用CNV分析

 

CNV(拷贝数变异)分析卵裂球样品采用PicoPLEX WGA Kit扩増标记后与BlueGnome®24sure® arrays杂交(Genesis Genetics Institute),结果清晰地显示了拷贝数变异2011年ESHRE (欧洲人类生殖与胚胎学会)的临床实验证明了采用PicoPLEX 技术进行人类染色体核型分析的准确性。

 

PicoPLEX技术

技术优势:利用特殊随机引物(Quasi-random primer)引发线性扩增进行全基因组扩增。

相比于以往的PCR、MDA、MALBC为基础的单细胞全基因组扩增技术,操作简单快速。扩增zui大优势:再现性良好。

 

PicoPLEX技术:单细胞在单管或单孔中裂解。在预扩增过程中,特殊随机引物与基因组DNA结合延伸,形成发夹结构文库,在接下来的扩增中,只有发夹结构的文库被扩增。

(中文版:单细胞 细胞裂解 模版DNA 变性与回收模版 退火引物 引物延伸 变性与引物重连 延伸;茎环形文库收集 扩增

*步:细胞裂解;第二步:预扩增 采用特殊随机引物选择性结合基因组DNA后进行扩增;第三步:扩增 使用含有illumina index的引物进行扩增)

 

应用

拷贝数变异分析-CNV(aCGH)

单核苷酸多态性分型-SNP

基因突变筛查-PCR

不能直接应用NGS,PicoPLEX DNA-seq Kit可以直接应用NGS。

 

扩展产品

PicoPLEX DNA-Seq (Picoseq) 技术在PicoPLEX WGA技术的基础上发展,扩增部分与PicoPLEX类似,但是在扩增的第二步,会加入Illumina接头和index(条形码)。

 

订购信息

 

货号

产品名称

包装

RB3050/R30050

 PicoPLEX WGA Kit单细胞基因组扩增试剂盒,array CGH、PCR分析用

50次反应

RB3381/R300381

PicoPLEX DNA-seq Kit,48种双端Illumina indexes

48次反应

 

 

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