产品英文名:TruSeq Small RNA Library Prep Kit
产品中文名:TruSeq小RNA文库制备试剂盒
TruSeq小RNA文库制备试剂盒提供用于从总RNA直接生成小RNA文库的试剂。试剂盒中附带的改良接头能够靶向通过Dicer处理产生的MicroRNA (miRNA)。
这些试剂盒通过引入48个*的标签实现多重测序,借此检出miRNA和小RNA,并对通量进行图谱分析,与Illumina测序无可企及的输出相得益彰。标签添加在通用扩增反应中,从而极大降低了连接偏向性,并确保了miRNA表达的测量准确度。
通过工作流程的改善,样本制备流程得以精简,从而可对任何物种中的所有小RNA转录本展开经济实惠的研究。兼容的应用包括探寻新miRNA、在单碱基分辨率下对同分异构体等变异进行特征分析,以及在不进行预先假设的情况下分析差异表达。
品牌 | 货号 | 产品描述 |
Illumina | RS-200-0012 | TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set A (24 rxns) (Set A: indexes 1-12) TruSeq小RNA文库制备试剂盒 - 套件A(24次反应)(套件A:1–12个标签) |
Illumina | RS-200-0024 | TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set B (24 rxns) (Set B: indexes 13-24) TruSeq小RNA文库制备试剂盒 - 套件B(24次反应)(套件B:13–24个标签) |
Illumina | RS-200-0036 | TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set C (24 rxns) (Set C: indexes 25-36) TruSeq小RNA文库制备试剂盒 - 套件C(24次反应)(套件C:25–36个标签) |
Illumina | RS-200-0048 | TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set D (24 rxns) (Set D: indices 37-48) TruSeq小RNA文库制备试剂盒 - 套件D(24次反应)(套件D:37–48个标签) |
Illumina | 20005613 | TruSeq Small RNA Set A MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件B MiniSeq试剂盒(1组文库制备和2个MiniSeq试剂) |
Illumina | 20005614 | TruSeq Small RNA Set B MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件B MiniSeq试剂盒(1组文库制备和2个MiniSeq试剂) |
Illumina | 20005615 | TruSeq Small RNA Set C MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件C MiniSeq试剂盒(1组文库制备和2个MiniSeq试剂) |
Illumina | 20005616 | TruSeq Small RNA Set D MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件D MiniSeq试剂盒(1组文库制备和2个MiniSeq试剂) |
TruSeq小RNA样本数据集
已使用TruSeq小RNA文库制备试剂盒制备人类大脑参考RNA (HBRR)和人类通用参考RNA (UHRR)样本。这些文库已使用片段长度配置为1 x 36碱基对的MiniSeq高输出试剂盒在MiniSeq系统上进行测序。总产量为0.91Gb,其中97%的碱基达到或超过Q30。
Specifications
Assay Time 分析时间 | 1 day 1天 |
Hands-On Time 手动操作 | 4 hours 4小时 |
Mechanism of Action 原理 | Captures small RNA with 3′ OH and 5′P modifications (like those processed by Dicer/Drosha)捕获小RNA |
Multiplexing | 48 unique indexes are available |
Species种属 | Any Species, Human, Mouse 任何物种,人,鼠 |
Specialized Sample Types 特殊样本类型 | FFPE, Low Input |
System Compatibility 兼容系统 | MiniSeq, MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 |
Technology 技术 | Sequencing 测序 |
Automation Capability 自动能力 | Liquid Handling Robots 液体处理机器人 |
Variant Class 突变级别 | Novel Transcripts, Transcript Variants 新转录字,转录子突变 |
Method 方法 | miRNA and Small RNA Sequencing miRNA和RNA测序 |
特别应用推荐:
CRISPR-Cas gRNA 验证
Cas9技术需要:II型 CRISPR–Cas 细菌免疫系统,包括 trans-activating CRISPR RNA (tracrRNA), CRISPR RNA (crRNA), Cas9 protein, and protospacer-adjacent motif (PAM)。
trans-activating CRISPR RNA (tracrRNA), CRISPR RNA (crRNA)作用:形成RNA双链,引导Cas9核酸内切酶和核酸序列配对。
Cas9和目标PAM序列连接。
关键点:guide RNA 和目标DNA的互补。
大多数商业Cas9基因编辑工具来源:Streptococcus pyogenes(链球菌)的II型 CRISPR–Cas 系统。不过自然界还存在很多具有基因编辑潜力的II型 CRISPR–Cas 系统。开发这种系统需要预测验证天然或基因工程来源的,驱动Cas9的单双链RNA。
因为导引RNA的长度较小(17-200碱基),适合使用TruSeq小RNA文库制备试剂盒(Reads 150nt)进行序列验证。
参考文献:
Prediction and Validation of Native and EngineeredCas9 Guide Sequences,Alexandra E. Briner,et al.
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