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MALBAC技术与Rubicon单细胞全基因组扩增试剂盒介绍
更新时间:2018-04-11   点击次数:5711次

Science杂志评选单细胞测序技术为2013年发展前景的六大科学项目之一,Nature Methods也将其选为Method of the Year 2013。

1、什么是MALBAC技术? 有何优势?

MALBAC™技术(Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles),即多次退火环状循环扩增技术,为一种单细胞全基因组扩增技术,先利用*的具有链置换活性的DNA聚合酶进行准线性的全基因组预扩增,再通过PCR技术进行指数式扩增,为下游分析提供充足的实验材料。MALBAC™技术源于哈佛大学。使用MALBAC技术的相关论文发表于*科学期刊《Cell》、《Science》、《PNAS》等,技术应用范围涉及生殖遗传、妇幼健康、肿瘤筛查与检验、生命科学研究等领域。使用MALBAC技术,科学家们完成了迄今覆盖度zui高的单精子基因图谱,对人类单个卵细胞完成了测序。

红荣微再 中国-现货供应 Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX  WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒

MALBAC技术优势:

1)    降低PCR扩增偏倚,使得单细胞中zui大90%以上的基因组能够被测序。

2)    MALBAC技术方法使得检测单细胞中较小的DNA序列变异变得更容易,因此能够发现个别细胞之间的遗传差异。这样的差异可以帮助解释癌症恶化的机制,生殖细胞形成机制,甚至是个别神经元的差异机制。

3)    灵敏度高:单细胞、单染色体或0.5pg的基因组DNA即可进行扩增。

4)    扩增均匀性显著优于其它同类技术,低覆盖度测序数据即可进行CNV分析,用于染色体三体检测及染色体微缺失变异检测。

5)    扩增产物用途广泛:可用于二代测序、微阵列、qPCR、基因克隆、Copy number variation (CNV) analysis: superior for oligonucleotide and BAC aCGH 、SNP genotyping 、Mutation detection by PCR等下游应用。

MALBAC™学术突破性进展:

1. 在*杂志发表文章:Science 、Cell 、PNAS、Annual Review等

2.严格验证MALBAC用于PGS的文章发表于ASRM(美国生殖医学学会)会刊

3.完成人类单个卵细胞的测序

4.完成迄今覆盖度zui高的单精子基因图谱

5.*无创植入前染色体筛查宝宝诞生,相关成果发表于《PNAS》

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2.什么是PicoPLEX技术?与MALBC相比 有何优势?

Rubicon Genomics公司使用技术PicoPLEX开发了*款构建一个高度可重复的单细胞全基因组文库扩增试剂盒:PicoPLEX WGA Kit ,该单细胞全基因组扩增试剂盒是目前世界上先进的单细胞全基因组扩增技术。

PicoPLEX相比于以往的MALBC、PCR和MDA为基础的单细胞全基因组扩增技术,操作更加简单快速。

PicoPLEX同样应用于拷贝数变异分析-CNV(aCGH)、单核苷酸多态性分型-SNP和基因突变筛查-PCR等,尤其适合用于单细胞染色体异倍性分析和拷贝数变异分析,是胚胎植入前基因筛查(PGS)胚细胞WGA的金标准。

 

PicoPLEX与MALBAC的区别

PicoPLEX技术与MALBAC相比,结果更准确、重复性更高,更适合用于单细胞染色体异倍性分析和拷贝数变异分析。

PicoPLEX单细胞技术比MALBAC更早

申请情况

Rubicon PicoPLEX: US8206913 Filed Date : Mar 3, 2010

MALBAC : WO2012/166425 International filing date : 22 May, 2012

 

主要区别

(1)MALBAC的细胞裂解时间更长。

MALBAC:30 min

 

PicoPLEX:15 min

 

 

(2)引物设计不同,PicoPLEX的结果更准确、重复性更高,更适合用于染色体异倍性分析和拷贝数变异分析。

 

参考文献:

The comparison of the performance of four whole genome amplification kits on ion proton platform in copy number variation detection.Zhang X1, et al.Biosci Rep. 2017 Jul 7.

>>>四种商业WGA试剂盒(包括MALBAC)比较结果Rubicon的PicoPLEX 具有较质量、保真性和可重复性,并且具有zui高一致性

 

3.PicoPLEX技术优势

1-10个细胞或 6 pg-60 pg纯化gDNA

适用于温和固定细胞

生成足够量的基因组样品用于qPCR,芯片和NGS分析。

可靠、可重复的解决方案,适用于单细胞染色体非整倍性分析和拷贝数变异分析。

胚胎植入前基因筛查(PGS)胚细胞WGA金标准。被世界范围内的PGS系统和服务机构广泛使用。

植入前基因筛查和诊断(PGS,PGD)是指体外受精(IVF)过程中所做的胚胎或卵母细胞测试,以便选择没有染色体变异和家族遗传病等位基因的胚胎,提高怀孕成功率,减少特定遗传病的传递风险。微阵列分析是IVF机构zui常用的PGS技术,这类试剂盒有好几种都嵌合了PicoPLEX技术,被广泛使用。包括Illuminas 24Sure 微阵列, Perkin Elmers KaryoLite BoBs developed for PGS和 Oxford Gene Technologys CytoSure™ 微阵列。

 

PicoPLEX产品引用文献 

 

PicoPLEX™ WGA Kit

1. Implantation potential of mosaic embryos

2. Lledo et al. 2017 Systems Biology in Reproductive Medicine

3.Vasculogenic mimicry in small cell lung cancer

4.Williamson et al. 2016 Nature Communications

5.Mouse model of chromosome mosaicism reveals lineage-specific depletion of aneuploid cells and normal developmental potential

6. Bolton et al. 2015 Nature Communications

7.Validation of copy number variation sequencing for detecting chromosome imbalances in human preimplantation embryos

8.Wang et al. Biol Reprod. 2014 Jun 25. pii: biolreprod.114.120576. DOI:10.1095/biolreprod.114.120576.

 

技术原理图 如下:

Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX  WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒

 

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Rubicon Genomics品牌介绍:

微量DNA的金钥匙:单细胞全基因组扩增试剂盒 三步法可靠 Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit Whole Genome Amplification from Single Cells

 

Rubicon Genomics成立于2000年,总部位于美国密歇根州。该公司的核心竞争力产品包括酶学、核酸化学、样品的加工生产,该公司致力于创新、知识产权的发展和持续的产品开发。

 

Rubicon Genomics开发创新、高品质的、核酸文库的制备及配套产品,能够对临床样本进行简单、快速可靠和高灵敏度的分析。

红荣微再(上海)生物工程技术有限公司为美国Rubicon Genomics公司在中国全资子公司授权代理商,咨询产品。Rubicon公司成立于2000年,公司总部位于美国密歇根州。Rubicon公司开发的产品主要基于“ThruPLEX®技术”和“PicoPLEX®技术”,可以微量DNA起始构建下一代测序文库。ThruPLEX®技术”可从血浆中的微量游离DNA构建高多样性文库,准确检测低丰度DNA变异,用途广泛。“PicoPLEX®技术”,可从单细胞等微量DNA起始构建高重复再现性文库,用于拷贝数变异分析和染色体异倍性分析。Rubicon产品丰富了Takara基于SMART®技术的下一代测序产品线,为科研工作者在基因组学、单细胞和临床应用研究等领域提供更多解决方案。

 

Rubicon Genomics公司产品订购信息如下:

品牌       产品编号       产品名称       单位       备注

Rubicon Genomics   RB3050  PicoPLEX WGA Kit 单细胞全基因组测序试剂盒   50Rxns  R30050

Rubicon Genomics   RB3381  PicoPLEX DNA-seq Kit DNA测序试剂盒     48Rxns  R300381

Rubicon Genomics   RB4406  ThruPLEX DNA-seq 48D Kit DNA测序试剂盒    48Rxns  R400406

Rubicon Genomics   RB4407  ThruPLEX DNA-seq 96D Kit DNA测序试剂盒    96Rxns  R400407

Rubicon Genomics   RB4427  ThruPLEX DNA-seq 48S Kit DNA测序试剂盒     48Rxns  R400427

Rubicon Genomics   RB4428  ThruPLEX DNA-seq 12S (48)Kit DNA测序试剂盒     48Rxns  R400428

Rubicon Genomics   RB4490  ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 基因测序试剂盒  12Rxns  R400490

Rubicon Genomics   RB4491  ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit 基因测序试剂盒  48Rxns  R400491

Rubicon Genomics   RB4492  ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit 基因测序试剂盒 96Rxns  R400492

Rubicon Genomics   RB4523  ThruPLEX DNA-seq 6S (12 )Kit DNA测序试剂盒      12Rxns  R400523

Rubicon Genomics   RB4584  ThruPLEX Tag-seq 6S(12)Kit 含标签基因测序试剂盒   12Rxns  R400584

Rubicon Genomics   RB4585  ThruPLEX Tag-seq 48S Kit 含标签基因测序试剂盒    48Rxns  R400585

Rubicon Genomics   RB4586  ThruPLEX Tag-seq 96D Kit 含标签基因测序试剂盒   96Rxns  R400586

 

欢迎您致电华雅再生医学旗舰公司:红荣微再(上海)生物工程技术有限公司

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